כל הכתות שקמו בעמ"י והקבוצות שרחקו בסופן של תהליך מתורת ה', הניפו את דגל השכל. קראים, צדוקים, מתיוונים. השכלה, רפורמים.
חוץ מההשכלה, היתר לא הניפו את דגל השכל. היו להם אידיאולוגיות שונות אבל לא קידשו שכל והשכלה כערך.
ולמעשה, הכתות הכי הרסניות ומעשי הניצול הכי נוראים, נעשו בשם 'ביטול השכל' ומחיקת מחשבתו העצמית של האדם.